El Comité Nacional de Residentado Médico es el máximo organismo del Sistema Nacional de Residentado Médico, y está integrado por:

a) Institución Rectora:

• El Director General de la Dirección General de Gestión del Desarrollo de Recursos Humanos del Ministerio de Salud.
  

b) Instituciones Formadoras en Residentado Médico:

• 01 representante de cada una de las cuatro Universidades Públicas con mayor número de médicos residentes matriculados en el año inmediato anterior. (UNMSM, UNFV, UNT, UNSA)
• 01 representante de cada una de las dos Universidades Privadas con mayor número de médicos residentes matriculados en el año inmediato anterior. (UPCH, USMP)

c) Instituciones Prestadoras de Servicios de Salud:

• 02 representantes de las Sedes Docentes de EsSalud.
• 01 representante de las Sedes Docentes del MINSA.
• 01 representante de las Sedes Docentes de los Gobiernos Regionales de Salud.
• 01 representante de las Sedes Docentes de las Sanidades del Ministerio del Interior.
• 01 representante de las Sedes Docentes de las Sanidades del Ministerio de Defensa.

d) Instituciones Representativas:

• 01 representante de la Asociación Peruana de Facultades de Medicina - ASPEFAM.
• 01 Representante del Colegio Médico del Perú.
• 01 Representante de la "Asociación Nacional de Médicos Residentes del Perú"